Autores: David Méndez; Mario Villamizar Cano y Harold Castro Barrera.
Resumen
En este artículo se describe la implementación LONI Pipeline como herramienta que facilita a los usuarios del área de bioinformática la ejecución de workflows en proyectos de e-ciencia. Se expone la instalación realizada de LONI Pipeline así como la infraestructura grid oportunista UnaGrid, utilizada para soportar, a bajo costo, los grandes requerimientos computacionales de aplicaciones de bioinformática como HMMER, NCBI Blast, MPI Blast e InterPro Scan. Se propone un modelo para integrar aplicaciones paralelas que usan Message Passing Interface (MPI) en LONI Pipeline, las cuales no son soportadas en la versión actual. Finalmente, se detallan los resultados de las pruebas ejecutadas con el modelo propuesto para las aplicaciones NCBI y MPI Blast. Los resultados demuestran que ahora los investigadores, a través del uso de las aplicaciones paralelas, ejecutadas de manera transparente a través de LONI Pipeline, pueden otener resultados en un menor tiempo.
