La Universidad Javeriana fue fundada inicialmente por la Compañía de Jesús de manera oficial en 1623 y su restauración la estableció la misma Compañía de Jesús en 1930. El hecho de haber sido fundada esta Universidad por la Compañía de Jesús, de manera inevitable incluye una perspectiva ética y moral propia de la institución fundadora. San Ignacio y sus compañeros fundaron la Compañía de Jesús en 1540. Habían obtenido su Doctorado en Teología en la Universidad de París. Sabían que las Universidades tenían gran importancia para el desarrollo de la ciencia y para la solidez del cristianismo porque ciencia y cristianismo habían estado estrechamente vinculados desde el surgimiento de la Universidad en Europa. Además consideraban que una formación bien estructurada de los jóvenes en las Universidades, fortalecía el ejercicio digno de las profesiones y honraba al cristianismo con la prestancia de profesionales de comportamiento intachable tanto en el campo de la ciencia como en su vida privada y social. San Ignacio fundó la primera Universidad jesuítica en Roma en 1551 y posteriormente la Compañía de Jesús continuó fundando Universidades en el mundo entero. En la actualidad cuenta con 114 situadas en casi todos los 127 países en que hoy ejerce su apostolado la Compañía de Jesús.
