El artículo presenta la metodología de diseño de un Biorreactor secuencial SBR requerido en el proceso de tratamiento de aguas residuales. El proceso aeróbico empleado ayuda a la oxigenación del agua para que las bacterias realicen la degradación y procesamiento de material particulado y generen los lodos activados, que es un material que puede ser reutilizado para compostaje en procesos de agricultura orgánica. La medición de PH en el agua ayuda al control de bacterias que se hace mediante el suministro de aire y/o levadura en el agua. El proyecto es desarrollado con la participación de estudiantes de los programas de Ingeniería Ambiental e Ingeniería Industrial, adscritos al semillero de investigación SIDI en el marco del proyecto de iniciación científica PIC-ING-2252, financiada por la Universidad Militar Nueva Granada [UMNG]. La metodología de diseño a emplearse en el diseño del SBR es la expuesta por Arzola [1] y Martínez [2], abordando inicialmente la matriz de despliegue de función de calidad (QfD), en el que se registran inicialmente los requerimientos del cliente para poderlos traducir a las especificaciones técnicas de ingeniería: posteriormente se desarrolla el diseño conceptual (caja gris), donde se plantean alternativas que dan cumplimiento a los requerimientos y a las especificaciones técnicas de ingeniería. Seleccionada la alternativa más viable, se procede al modelamiento, cálculo y selección de componentes a ser utilizados en el concepto seleccionado como alternativa de desarrollo. Finalmente, se realiza la ingeniería de detalle mediante modelamiento CAD.